Jak přesné jsou PCR testy na covid-19?

Vlastně bych mohl tento článek ukončit hned tady, protože jediný důvod proč jsem ho na D-FENS poslal je právě ona otázka v titulku. Já opravdu nevím a nedaří se mi najít žádná prokázaná čísla týkající se přesnosti s jakou PCR testy na covid-19 odhalují pozitivní, ale hlavně s jakou pravděpodobností označí zdravého jedince jako pozitivního. Takže prosím o odpovědi nebo odkazy na dostupné studie do komentářů. Díky.

A aby to tu nebylo zas tak krátké, zkusím vysvětlit proč je to naprosto klíčová otázka. Odborně správně formulovaná zní – jaká je senzitivita a specificita PCR testu na SARS-CoV-2?

Osobně se mi podařilo dohledat čísla 100/96 v ideálních podmínkách a 70/95 v běžných (výtěr nosem, pro výtěr krkem je první číslo nižší, padá až ke 30%). Tato čísla odpovídají i běžně používaným PCR testům na jiná virová onemocnění, takže je zkusme prozatím použít.

Co tedy znamená oněch 70/95?

Řekněme že máme vzorek 100 lidí, z nichž 80 je nakažených. Test se senzitivitou/specificitou 70/95 z tohoto vzorku odhalí:

Senzitivita 70 znamená že 70% z 80 skutečně nakažených, tj. 56 je správně označeno jako nakažení / pozitivní

Zbývajících 30% z 80 skutečně nakažených, tj. 24 je chybně označeno jako zdraví / negativní

Specificita 95 znamená že 95% z 20 zdravých, tj. 19 je správně označeno jako zdraví / negativní

Zbývajících 5% z 20 zdravých, tj. 1 je chybně označeno jako nakažený / pozitivní

Takže testu s přesností 70/95 na vzorku 100 osob uteče 24 nemocných a naopak jednoho zdravého chybně označíme jako nemocného. Jenže se bavíme o původním vzorku ve kterém je infikováno 80% osob.

Co za výsledky můžeme očekávat u testu se specificitou 95-96, když náš vzorek bude 7000 lidí (tj. běžný počet testů prováděných v posledních dnech) a NIKDO v něm nebude nemocný? Ano, test “odhalí” asi 280-350 falešně pozitivních. Pevně doufám že mi někdo v diskuzi pošlete odkaz na nějakou studii která mě uklidní a vysvětlí, že specificita testu je přece samozřejmě 99% a vyšší. A že vůbec nezáleží na výrobci master mixu pro ten PCR test. Nebo laboratoři která test provádí. Nebo na přístroji na kterém se test provádí. Nebo mi odhalíte kde mám chybu ve výpočtu. Opravdu v to doufám.

Poznámka – článek je silně ovlivněn podobným článkem, který jsem před časem četl, rozebírajícím a vysvětlujícím senzitivitu a specificitu testů na drogy prováděnou při silničních kontrololách. Tímto neznámému autorovi děkuji za inspiraci.

16.08.2020 AB-CD

Související články: